Как класть клинкер: Как класть клинкерную плитку на стену, ступеньки, цоколь

как клеить на фасад, особенности монтажа, схема раскладки

Укладка клинкерной плитки – работа кропотливая, требующая повышенного внимания. Только при соблюдении технологии материал прослужит длительное время, играя защитную и декоративную роль.

Вам нравится клинкерная плитка в интерьере?

ДаНет

Содержание

1. Особенности клинкерной плитки
2. Свойства клинкера
3. Классификация изделий
4. Выбор клеевого состава в зависимости от типа поверхности
5. Укладка клинкерной плитки своими руками
6. Подготовка основания
7. Процесс раскройки материала
8. Облицовка стен и проемов
9. Особенности проведения наружных работ на фасаде
10. Использование дополнительных материалов и инструментов

Для изготовления клинкерной плитки используется глина, которая очищена от всяких примесей (сланцевая, торфяная). В сырье добавляются оксид железа, песок, связующие вещества. Заготовки формируются при помощи экструдера или делаются вручную. Изделия обжигаются при температуре, доходящей до 1 300 градусов, в течение нескольких суток. В результате получается плитка, которая однородна по структуре и имеет сплошную окраску.

Размеры: ширина — 64 мм, длина – 240 мм. Хотя существуют и другие варианты габаритов клинкерной плитки. Толщина изделий варьируется от 7 до 20 мм.

Обратите внимание! Для жилых помещений оптимальной является толщина 10-12 мм.

Материал подходит для отделки:

• коридоров, прихожих, комнат;
• объектов с незначительной механической нагрузкой;
• зданий общественного назначения;
• помещений с небольшой проходимостью.

Подбираются изделия в соответствии со степенью износостойкости.

Читайте также: Встроенная душевая кабина из кафеля без поддона

Свойства клинкера

Свойства клинкерной плитки – это ее достоинства. К ним относится:

• Высокая прочность. Из аналогичных отделочных материалов клинкер является самым прочным.
  Способен выдерживать 400 кг/см2, а некоторые образцы до 800 кг/см2.
• Водопоглощение. Благодаря высокой плотности, допустимо использование изделий для обустройства фасада и оформления стен в помещениях с повышенной влажностью.
• Экологическая безопасность. В составе только чистые природные компоненты.
• Морозостойкость. За счет низкого водопоглощения, изделия способны выдерживать большие морозы. Замораживать и оттаивать материал может на протяжении 15-50 циклов без структурных изменений.
• Пожаробезопасность. Клинкер не воспламеняется, не поддерживает горение.
• Сохранение цвета. Изделия не теряют насыщенности даже под воздействием солнечных лучей.

Показатель	Значение
Водопоглощение	Менее 6%
Морозостойкость	Не менее 150 циклов
Прочность	200 Мпа
Плотность	От 1400-1900 кг/м.куб
Теплопроводность	0. 45-0.6 Ватт/мс
Паропроницаемость	0.07 мг/(м*ч*Па)

Недостатки имеются. Производить клинкерную кладку достаточно сложно из-за трудностей с раскроем высокопрочного материала – важно, чтобы был хороший инструмент. Массивность плитки также можно отнести к минусам, так как не каждая поверхность подходит для такой нагрузки. Кроме того, материал дорогой.

Может быть интересно: Как спрятать коммуникации в ванной

Классификация изделий

В зависимости от поверхности, изделия делятся на классы:

• А. Допускается использование в промышленном секторе. Характеризуется высокой устойчивостью к химическим веществам.
• Б. Предназначается для объектов, где размещаются продукты питания, а также осуществляется их приготовление. Могут появиться пятна от взаимодействия с химическими реагентами.
• В. Не меняют свойств от контакта со средствами, которыми моют и чистят поверхности.
• Г. Изделия применяются в бассейнах, так как устойчивы к воде и дезинфицирующим составам.

Кроме того, лицевая поверхность имеет цифровой идентификатор:

• 9 – глазурованная;
• 10, 11, 12 – вариант для помещений с повышенной влажностью, также для холодильных камер, лабораторий;
• 13 – исключает падения на мокром поту, являясь мелкозернистым абразивом.

Выбирать следует, внимательно изучив классификацию и особенности каждого вида плитки.

Может быть интересно: Укладка плитки на пол без швов

Выбор клеевого состава в зависимости от типа поверхности

При выборе клеевого состава для облицовки дома клинкером нужно обращать внимание на то, что плитка имеет немалый вес. Получается, что сухой остаток вещества, используемого для фиксации, должен обладать хорошей адгезией и быть очень прочным на отрыв. Кроме того, коэффициент теплового расширения клинкера ниже, чем у кирпича или бетона, поэтому клей должен исключать вероятность отслоения декоративной отделки при перепадах температур. При выборе клеевого состава следует учитывать:

• вязкость;
• устойчивость к температурным изменениям и влаге;
• сцепление с поверхностью;
• эластичность;
• прочность на отрыв.

Для монтажа клинкерной плитки подходят следующие типы клеевых растворов:

• Цементный. В составе песок и пластификаторы. Используется для внутренних и наружных работ.

Может быть интересно: Керамическая плитка под кирпич

• Однокомпонентный. Продается в виде однородной эластичной пасты. Есть минус – долго сохнет.

• Двухкомпонентный. Обладает высокой прочностью на отрыв и отличным сцеплением. Перед применением смешивается эпоксидная основа с отвердителем.

Перед покупкой необходимо ознакомиться с информацией, указанной на упаковке, так как есть ограничения по нагрузке, температуре, степени влажности.

Для отделки применяется две разновидности материала: основной и угловой. Первый для раскладки на плоских поверхностях, второй – на углы. Рассчитать количество требуемых изделий несложно: длина и высота стены умножаются, из полученного результата вычитаются площади, которые не подлежат облицовке (окна, двери).

Укладка клинкера проходит в несколько этапов. Каждый из них требует соблюдения определенных правил. Если придерживаться особенностей технологии, то заняться монтажом клинкера можно самостоятельно.

Может быть интересно: Укладка гипсовой плитки на стену

Подготовка основания

Клинкерную плитку можно укладывать на всякие поверхности – деревянные, бетонные, каменные. Подготовить основание – это значит создать идеально ровную поверхность, которая не должна иметь никаких дефектов. Основание должно быть чистым и сухим.  При любых отклонениях результат работ будет недолговечным. Лучше сразу сбить выступающие бугорки, а выемки заштукатурить – тогда укладка клинкера будет быстрой и качественной.

Обратите внимание! Клеевой состав наносится гребенчатым шпателем, который работает лишь по ровным плоскостям.

Порядок действий перед монтажом клинкера одинаковый, независимо от того, куда она будет размещаться – пол, стены:

• полное очищение поверхностей от старых покрытий;
• удаление отслоений и коррозий;
• обработка поверхности упрочняющими и обеззараживающими составами;
• формирование углов, как внутри, так и снаружи с армированием;
• покрытие трещинок и больших пор с целью заполнения;
• вторичная обработка грунтовкой;
• выравнивание при помощи фиброволокна либо штукатурной сетки.

Важно! Поверхности из древесины покрываются антистатическими и влагозащитными средствами.

Процесс раскройки материала

По твердости клинкер можно сравнить со стеклом. Распиливать материал нельзя, так как он трескается, разбивается, появляются сколы. Остается один способ раскройки – использование диска с алмазным напылением.

Может быть интересно: Как приклеить отвалившуюся плитку?

Облицовка стен и проемов

Крепление клинкера начинается с нижнего ряда. Поскольку изделия нетяжелые, то можно клеить плитку, начиная сверху. Способы монтажа различные:

• Вразбежку. Такой способ подходит для отделки с неровными краями.
• Ложковая перевязка. При монтаже соблюдаются направления по горизонтали или диагонали.
• Цепная перевязка. Делается с попарным соединением элементов.
• «Рыбья кость». Элементы располагаются перпендикулярно.
• Переплетение с промежутками.

Может быть интересно: Теплый пол электрический в ванной

Приклеивать плитки нужно также, как класть клинкерные кирпичи – между ними соблюдается такое же расстояние. Ширина шва варьируется от 8 до 15 мм. Для точности используются крестики. Соблюдается и глубина – клинкер выступает приблизительно на 3 мм после проведения затирки. Изнанка клинкерной плитки рельефная, поэтому пустоты тщательно заполняются клеевым составом с применением мастерка.

Может быть интересно: Столешница для кухни из плитки своими руками

Перед укладкой клинкерных изделий, выполняется облицовка откосов, чтобы число обрезанных элементов было минимальным. А может и вовсе удастся обойтись без того, чем резать керамическую плитку. Клей используется с высокой вязкостью, который быстро отвердевает, что важно для отделки верхней части проема.

Может быть интересно: Как выложить плитку в ванной своими руками

На конечном этапе производится затирка с целью закрепить покрытия, защитить швы, создать эстетичный вид. Затираются швы после полного высыхания клеевого состава.

Может быть интересно:

Раскладка плитки елочкой

 

Особенности проведения наружных работ на фасаде

Для выполнения облицовки наружной стороны здания берется пустотелая плитка с вертикальными пустотами или полнотелые фасадные изделия. Для фасада применяются материалы цвета рыже-красного кирпича, а также цветные. Фактура фасадного клинкера разная: с песчинками, абсолютно гладкая, ребристая. Монтаж производится по мокрой или сухой технологии. В схему укладки входит:

• основание;
• изоляционная плита;
• якоря;
• клей;
• клинкерная плита.

Обратите внимание! На фасад материал укладывается при температуре +5-+30 градусов. Температурные перепады приводят к деформации материала (сжатие, расширение). Не производятся работы в дождливую погоду, так как попавшая в раствор вода изменит его свойства не в лучшую сторону.

При наружной отделке часто используются комбинированные варианты из клинкерной плитки со слоем утеплительного материала в виде облицовки:

• с учтенной полостью для устройства вентиляции;
• с поперечным покрытием без промежутка для вентиляции;
• сочетание термоизоляционной отслойки и клинкерной обшивкой, которая ее будет предохранять.

Может быть интересно: Укладка кварцвиниловой плитки на клей

Производится облицовка на некотором расстоянии от несущей стены. Это необходимо для правильной циркуляции воздуха. Сопряжение несущей стены и отделочной прослойки получается, за счет использования антикоррозийной проволоки из стали. Она размещается на расстоянии четырех рядов кладки.

Важно! Для отделки цоколя или фасада требуется клей высокого качества. Он должен выдерживать температурные перепады и быть стойким к негативным воздействиям окружающей среды.

Использование дополнительных материалов и инструментов

Для укладки требуются основные материалы и инструменты следующие:

• миксер для замешивания раствора;
• шпатели зубчатый и резиновый;
• грунтовка;
• резиновый молоток;
• строительный уровень, отвес, угольник, длинное правило;
• шприц для заполнения швов;
• металлический профиль или рейка из дерева, чтобы правильно задать направление;
• валик, кисть;
• щетка металлическая для очищения налипших частичек раствора.

Кроме того, для проведения работ на высоте требуются строительные леса.

Несмотря на немалую стоимость, клинкерная плитка приобретает популярность. Востребованность объясняется высоким качеством продукции, отличной тепловой изоляцией стен, декоративными свойствами. Чтобы здание приобрело красивый презентабельный вид и было надежно защищено, необходимо соблюдать технологию укладки с учетом всех нюансов.

Может быть интересно: Укладка плитки с уголками

Кирпич

0%

Сайдинг

0%

Фасадная краска

33.33%

Натуральный камень

0%

Керамическая плитка под кирпич

33.33%

Керамическая плитка под натуральный камень

33. 33%

Проголосовало: 3

Как класть брусчатку на бетон? Правила укладки клинкерной плитки

Профессиональные строители-каменщики считают укладку клинкерной брусчатки лучшим способом отделки садовых и пешеходных дорожек, а также площадок и зон отдыха.

Их мнение обосновывается наличием отменных качественных свойств у плитки из обожженной глины. Высокая прочность, морозоустойчивость, низкая водопоглощаемость, долговечность – вот основные преимущества клинкерной брусчатки от других отделочных материалов. Удобные технические параметры, форма и многообразие цветов блоков позволяют воплощать в жизнь любые схемы укладки.

Наиболее устойчивым к большим нагрузкам является покрытие из клинкера, мощенного на бетонное основание, именно поэтому его применяют для создания отмосток и площадок на проблемных земельных участках.

Перечень материалов и инструментов

Для укладки клинкерной брусчатки на бетонное основание понадобятся:

• шнур и рулетка;

• строительный уровень;

• лопата и грабли;

• болгарка с диском для резки камня;

• шпатель или мастерок для раствора;

• виброплита для трамбовки;

• шланг с водой.

В качестве исходного материала необходимо взять нужное количество тротуарной плитки, армированная сетка, бордюр, щебень и вещества для раствора (песок и цемент).

Подготовительные работы

Создание бетонного основания является важной частью при подготовке площадки к мощению клинкерной брусчатки. Существует несколько этапов создания идеально ровной основы:

• Вынимание грунта на глубину около 25 см, согласно предварительно сделанной разметке.

• Очистка дна от остатков земли и тщательная трамбовка с соблюдением уклонов.

• Засыпка щебня (фракция 5-20 мм), выравнивание и уплотнение слоя.

• Установка опалубки из деревянных досок, толщина которых должна быть не менее 40 мм.

• Для создания бетонного основания внушительных размеров (более 15 кв.м.) необходимо создать термические швы, которые предотвратят потрескивание поверхности.

• Приготовление армированной сетки или прутьев для армирования бетона.

• Бетонная смесь состоит из песка, цемента и щебня (3:1:2). Её заливают на установленную армированную сетку, формируя уровни и уклоны.

С застывшего бетонного основания удаляется опалубка, и прочищаются траншеи. Затем площадка огораживается бордюрными блоками, укрепляя со дна и наружной стороны цементным раствором.

Основные правила укладки клинкерной плитки

Технология устройства площадок и дорожек клинкерной плиткой для всех видов оснований идентична. Стяжка из бетона перед мощением клинкером должна быть засыпана и утрамбована слоем песка или древесного отвеса толщиной около 30 мм. Именно на такую поверхность осуществляется укладка брусчатки.

Для начала производится крепление ориентировочных шнуров. Затем начинается укладка плиток с тщательным уплотнением каждого блока. При необходимости цельный кирпич можно разделить на несколько частей, используя болгарку с алмазным диском для резки натурального камня.

По окончании мощения площадки швы между брусчаткой засыпаются песком и проливаются водой. Смесь хорошо распределяется по поверхности при помощи щетки. Готовое покрытие утрамбовывается виброплитой. Процедура с просыпанием песка проводится около четырех раз в течение месяца после укладки.

Ландшафтный дизайн: Мощение клинкерным кирпичом – чтобы ваш подъезд приобрел особый шарм

Содержание статьи:

• ➤ Преимущества брусчатки
• ➤ Укладка тротуарной плитки – пошаговая инструкция
  • ➥ Шаг 1: Подготовка
  • ➥Шаг 2: выполнение земляных работ
  • ➥ Шаг 3: Укладка цокольного слоя 90 007
  • ➥ Шаг 4: Подать заявку подстилающий материал
  • ➥ Шаг 5: Укладка клинкерной штукатурки
  • ➥ Шаг 6: Укладка тротуарной плитки из клинкера

Подъездная дорожка из клинкерного кирпича имеет свой характер и отличается долговечностью и прочностью. Однако планирование и подготовка здесь занимают немного больше времени.

Мощеные поверхности из бетонных блоков есть практически у всех, даже дерево можно найти во многих свойствах снова. В районе проезжей части дерево скорее обескураживает. Дерево не обязательно предназначено для того, чтобы постоянно по нему ездить. Кроме того, древесину необходимо регулярно обслуживать и обрабатывать, чтобы она могла противостоять погодным условиям.

Хотя клинкерный кирпич является одним из самых дорогих видов мощения, он оставляет свое очарование. Хотя в прошлом эти камни были красными, теперь вы можете выбирать из более широкого диапазона от желтоватого до почти черного. Важно только, чтобы он подходил и к фасаду дома. Ведь общая картина тоже должна радовать без исключения.

Крупные компании, такие как Röben и Wienerberger, предлагают большое количество различных видов клинкера. В магазине строительных материалов на месте или в хозяйственном магазине в вашем районе у вас наверняка будет возможность внимательно рассмотреть камни.

➤ Преимущества тротуарной плитки

Клинкерная брусчатка, особенно на подъездных дорожках или террасах, имеет решающие преимущества. Клинкеры особенно трудно сгорают и, следовательно, более устойчивы к атмосферным воздействиям, чем деревянные и бетонные блоки. Они могут впитывать очень мало влаги, поэтому зимой гарантированно не замерзнут.

Еще одним преимуществом является надежность, что, конечно же, особенно важно в области транспортных средств. Важным здесь является только соответствие несущей конструкции несущей способности.

➤ Укладка тротуарной плитки – пошаговые инструкции

Когда вы получите брусчатку, можно приступать к подготовке крыла.

Прежде чем приступить к работе, вы должны получить все необходимые материалы и оборудование. Как только вы начнете, вы, наконец, захотите пройти и не останавливаться из-за пропущенных вещей.

По опыту могу сказать, что укладка брусчатки может быть очень приятной для неопытных в тылу людей. Утомительна не только укладка, но и постоянная перевозка камней тележкой. Поэтому вам следует подумать, брать ли на короткое время для строительства тележку с поддонами или, возможно, даже вилочный погрузчик. Так вы сможете загонять камни по мере необходимости в нужное место, не лежа вечером с ноющей спиной на диване. Такие компании, как cegema.de, предлагают широкую сеть по всей Германии для аренды различной строительной техники. Но также некоторые местные строительные компании часто сдают свои автомобили за определенную плату частным лицам. Спрос экономит много времени и сил.

Итак, когда вы все организовали, можно начинать.

➥ Шаг 1: Подготовка

Перед укладкой новой брусчатки необходимо позаботиться о основании. Без них вы не получите удовольствия от клинкера.

В зависимости от характера вашей системы, вы должны сначала очистить поверхность, на которой будет производиться мощение. Под брусчатку необходимо подложить базовый слой, чтобы впоследствии камни могли выдерживать и нагрузку автомобилей.

Для мощения необходимо предусмотреть уклон 2,5 %. Разумеется, уклон должен уводить от дома. Лучше всего натянуть шнуры, по которым можно ориентироваться в любое время.

➥Шаг 2: выполнить раскопки

Теперь вы можете выполнить Ausköseung. В зависимости от площади либо лопатой, либо быстрее, само собой разумеется экскаватором. Копайте так глубоко, чтобы после раскопок вы оказались как минимум на 20 сантиметров ниже готовой высоты тротуара. Встряхнуть выкопанную поверхность лучше всего вибратором или, как вариант, грунтовой трамбовкой. Джоггеры также можно взять напрокат во многих магазинах DIY. Например, Hornbach.de предлагает такую ​​услугу. Это доступно не во всех городах. (Вот список всех городов-участников)

➥ Шаг 3: Укладка базового слоя

Чтобы камни не тонули потом и в худшем случае не лопнули, необходимо внести базовый слой. Он должен состоять из песчано-гравийной смеси (фракция 0–32) и иметь высоту не менее 10–30 дюймов. Затем его нужно снова встряхнуть, чтобы все оставалось стабильным. Также подумайте о градиенте.

➥ Шаг 4: Нанесение подстилочного материала

После того, как базовый слой готов, наносится так называемый подстилающий материал. В эту «постель» затем укладывается клинкер. Материал подсыпки обычно состоит из дробленого песка или щебня. Равномерно распределите эту массу на укладываемой поверхности и снимите эту поверхность с помощью пластины для снятия пленки. Чем лучше вы произведете подготовку, тем легче будет укладка. Тогда вам просто нужно надеть его, и все готово.

➥ Шаг 5: Укладка клинкерной штукатурки

Теперь самое красивое – наконец-то вы можете увидеть результат. То, как вы будете укладывать брусчатку, полностью зависит от ваших пожеланий и идей. На сайте abs-klinker.de вы найдете обзор шести различных способов укладки. Одни довольно простые и быстро укладываются, другие более сложные. Решать. Клинкер перемещают соответствующим образом и слегка постукивают резиновым молотком.

➥ Шаг 6: Уплотнение клинкерной плитки

Чтобы клинкерные кирпичи после укладки прочно держались, в конце их необходимо уплотнить. Лучше всего для этого подходит гравий. Это распределяется по площади, а затем заметается в суставы с помощью веника. Наконец, дайте ему стечь и дайте ему стечь.

Видеоплата: .

Поделись с друзьями!

Посадка и выращивание чашечек – вот как это делается

Эти декоративные травы придают цвет осенью

Сад рядного дома из ряда

Ароматные орхидеи – сорта и уход

Цветущий дворик для романтиков

клинкер · PyPI

И cblaster, и clinker теперь можно использовать без установки на веб-сервере CAGECAT.

Генератор сравнения групп генов

Что это такое?

клинкер — это конвейер для простого создания генного кластера качества публикации. цифры сравнения.

Учитывая набор файлов GenBank, clinker автоматически извлекает переводы белков, выполнить глобальное выравнивание между последовательностями в каждом кластере, определить оптимальный порядок отображения на основе сходства кластеров и создание интерактивного визуализация (с помощью clustermap.js) который можно тщательно настроить перед экспортом в виде файла SVG.

Примечание по объему:

клинкер был разработан в первую очередь как простой способ визуализации групп гомологичных кластеры биосинтетических генов, которые обычно представляют собой небольшие геномные области с небольшим количеством генов (как в примере GIF). Он выполняет попарное выравнивание всех генов во всех входных файлах, используя выравниватель, встроенный в BioPython, затем создает интерактивный документ SVG в браузере. Стадия выравнивания будет очень плохо масштабироваться для нескольких геномов со многими генами, и в результате визуализация также будет очень медленной, учитывая, сколько SVG-элементов она будет содержать. Если вы хотите выровнять целые геномы, вам, вероятно, будет лучше использовать инструменты, созданные для этой цели (например, Cactus).

Установка

clinker можно установить напрямую через pip:

pip install clinker

Путем клонирования исходного кода с GitHub:

 git clone https://github. com/gamcil/clinker.git
cd клинкер
установка пипа.
 

Или через conda:

 conda create -n clinker -c conda-forge -c bioconda clinker-py
conda активирует клинкер
 

Citation

Если вы нашли клинкер полезным, укажите:

 clinker & clustermap.js: Автоматическая генерация сравнительных фигур генных кластеров.
Гилкрист, CLM, Chooi, Y.-H., 2020.
Биоинформатика. Дои: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab007
 

Использование

Работа с клинкером может быть такой простой, как:

кластеры клинкера/*. gbk

Это считывает все файлы GenBank внутри папки, выравнивает их и печатает. выравнивание к терминалу. Для создания визуализации используйте -p/--plot аргумент:

clinker clusters/*.gbk -p <необязательно: имя файла для сохранения статического HTML>

clinker также может анализировать файлы GFF3:

clinker cluster1.gff3 cluster2.gff3 -p

900 25 Примечание: соответствующий Одноименный файл FASTA (расширения «.fa», «.fsa», «.fna», «.fasta» или «.faa») должен можно найти в том же каталоге, что и GFF3, т. е. cluster1.fa и cluster2.fa .

См. -h/--help для получения дополнительной информации:

 использование: clinker [-h] [--версия] [-r ДИАПАЗОНЫ [ДИАПАЗОНЫ ...]] [-gf GENE_FUNCTIONS] [-na] [-i ИДЕНТИЧНОСТЬ] [-j РАБОТЫ] [-s СЕССИЯ] [ -ji JSON_INDENT] [-f] [-o ВЫВОД] [-p [ГРАФИК]] [-dl РАЗДЕЛИТЕЛЬ] [-dc ДЕСЯТИЧНЫЕ ЗНАЧЕНИЯ] [-hl] [-ha] [-mo МАТРИЦА_ВЫВОД] [-ufo] [файлы .  ..]
clinker: Автоматическое создание готовых к публикации фигур для сравнения генных кластеров.
clinker генерирует цифры сравнения кластеров генов из файлов GenBank. Он выполняет попарное локальное или глобальное выравнивание между каждой последовательностью в каждой уникальной паре кластеров и генерирует интерактивные сравнительные данные в масштабе с использованием библиотеки clustermap.js.
необязательные аргументы:
  -h, --help показать это справочное сообщение и выйти
  --version показать номер версии программы и выйти
Варианты ввода:
  файлы Генный кластер GenBank файлы
  -r ДИАПАЗОНЫ [ДИАПАЗОНЫ ...], --ranges ДИАПАЗОНЫ [ДИАПАЗОНЫ ...]
                        Диапазоны извлечения лесов. Если указан диапазон, из каркаса будут извлечены только объекты в пределах этого диапазона. Диапазоны должны иметь следующий формат: scaffold:start-end (например, scaffold_1:15000-40000)
  -gf GENE_FUNCTIONS, --gene_functions GENE_FUNCTIONS
                        Файл CSV с двумя столбцами, содержащий функции генов, используемый для построения групп генов на основе одной и той же функции, а не сходства последовательностей (например, GENE_001, PKS-NRPS). 
Варианты выравнивания:
  -na, --no_align Не выравнивать кластеры
  -i ИДЕНТИФИКАЦИЯ, --identity ИДЕНТИЧНОСТЬ
                        Минимальная идентичность последовательности выравнивания [по умолчанию: 0,3]
  -j JOBS, --jobs JOBS Количество параллельных выравниваний (0, чтобы использовать количество процессоров) [по умолчанию: 0]
Варианты вывода:
  -s СЕССИЯ, --session СЕССИЯ
                        Путь к клинкерной сессии
  -ji JSON_INDENT, --json_indent JSON_INDENT
                        Количество пробелов для отступа JSON [по умолчанию: нет]
  -f, --force Перезаписать предыдущий выходной файл
  -o ВЫВОД, --output ВЫВОД
                        Сохранить выравнивания в файл
  -p [ГРАФИК], --plot [ГРАФИК]
                        Постройте выравнивание кластеров с помощью clustermap.js. Если указан путь, clinker сгенерирует переносимый HTML-файл по этому пути. В противном случае график будет обслуживаться динамически с использованием HTTP-сервера Python.
  -dl DELIMITER, --delimiter DELIMITER
                        Символ для разделения вывода [по умолчанию: удобочитаемый]
  -dc ДЕСЯТИЧНЫЕ ЗНАКИ, --decimals ДЕСЯТИЧНЫЕ ЗНАКИ
                        Количество знаков после запятой в выводе [по умолчанию: 2]
  -hl, --hide_link_headers
                        Скрыть заголовки столбцов выравнивания
  -ха, --hide_aln_headers
                        Скрыть заголовки имени кластера выравнивания
  -mo МАТРИЦА_ВЫХОД, --matrix_out МАТРИЦА_ВЫХОД
                        Сохранить матрицу сходства кластеров в файл
Варианты визуализации:
  -ufo, --use_file_order
                        Отображение кластеров в порядке входных файлов
Пример использования
-------------
Совместите кластеры, нарисуйте результаты и распечатайте результаты на экране:
  $ клинкерные файлы/*. gbk
Сохраняйте связи между генами только тогда, когда идентичность превышает 50%:
  $ клинкерные файлы/*.gbk -i 0.5
Сохраните сеанс выравнивания на потом:
  $ clinker files/*.gbk -s session.json
Сохраните выравнивания в файл в формате с разделителями-запятыми, с 4 десятичными знаками:
  $ clinker files/*.gbk -oalignments.csv -dl "," -dc 4
Создать визуализацию:
  $ клинкерные файлы/*.gbk -p
Сохраните визуализацию как статический HTML-документ:
  $ клинкерные файлы/*.gbk -p plot.html
Кэмерон Гилкрист, 2020 г.
 

Определение групп генов по функции

По умолчанию clinker автоматически присваивает имя и цвет каждой группе гомологичных генов. Вместо этого вы можете предварительно назначить имена (т. е. функции), используя аргумент -gf/--gene_functions , который принимает файл с двумя столбцами, разделенными запятыми, например:

 GENE_001,Cytochrome P450
GENE_002, Цитохром P450
GENE_003, метилтрансфераза
GENE_004, метилтрансфераза
 

Это создаст две группы: цитохром P450 (GENE_001 и 002) и метилтрансферазу (GENE_003, GENE_004).