Масштаб по госту для чертежей: Масштабы чертежей

{{l10n_strings.DRAG_TEXT_HELP}}

{{article.content_lang.display}}

{{l10n_strings.AUTHOR_TOOLTIP_TEXT}}

Rolls-Royce Silver Ghost векторный рисунок

Все чертежи автомобилей выполнены в масштабе 1:25; большинство чертежей самолетов выполнены в масштабе 1:72, 1: 100, 1: 250 и 1: 500; остальные рисунки имеют разный масштаб: это всегда указано на рисунке в левом нижнем углу.

Файлы Illustrator создаются с помощью Adobe Illustrator CS3, CS4, CS5, CS6 и CC; если вы работаете в более ранней или более старой версии Illustrator, я могу экспортировать файл как устаревший формат для вас.

Размеры на векторных рисунках автомобиля указаны в единицах СИ, а значит, в миллиметрах.

Rolls-Royce Silver Ghost наброски
Шаблоны Rolls-Royce Silver Ghost
Rolls-Royce Silver Ghost чертежи CAD
Rolls-Royce Silver Ghost чертежи
Rolls-Royce Silver Ghost чертежи линий
Rolls-Royce Silver Ghost чертежи подписчиков
Rolls-Royce Silver Ghost виниловый шаблон
Rolls-Royce Silver Ghost клип-арт
Rolls-Royce Silver Ghost виниловая графика
Rolls-Royce Silver Ghost фольгированный шаблон

Rolls-Royce Silver Ghost бестикеринг
Rolls-Royce Silver Ghost belettering
Rolls-Royce Silver Ghost автозапуск -Royce Silver Ghost fahrzeugwerbung
Rolls-Royce Silver Ghost маркирует рекламные объявления

Rolls-Royce Silver Ghost enseigne автомобиль
Rolls-Royce Silver Ghost марочные автомобили
Rolls-Royce Silver Ghost комплекты
Rolls-Royce Silver Ghost autocollant
Rolls-Royce Silver Ghost создание публики
Rolls-Royce Silver Royce Royce
Rolls-Royce Silver Royce
Rolls-Royce Silver Royce
Ghost comunicação visual
Rolls-Royce Silver Ghost ротации
Rolls-Royce Silver Ghost персонализация

Rolls-Royce Silver Ghost – персонализация изображения
Rolls-Royce Silver Ghost – конверт
Rolls-Royce Silver Ghost с надписью
Rolls-Royce Silver Ghost serigrafia
Rolls-Royce Silver Ghost rotulacion
Rolls-Royce Silver Ghost
Rolls-Royce Silver Ghost
Rolls-Royce Silver Ghost
Rolls-Royce Silver Ghost Ghost señaleticas
Rolls-Royce Silver Ghost autoadhesiva
Rolls-Royce Silver Ghost билдекор
Rolls-Royce Silver Ghost билрекламе
Rolls-Royce Silver Ghost билрекламер

Автомобиль Rolls-Royce Silver Ghost в общих чертах художественная станция

Ghost | Вукипедия | Фэндом

Максимальная скорость (атмосфера)

Рейтинг гипердвигателя

• Класс 2 ^[5]
• Класс 14 (резервный) ^[2]

Подарок за сражения / события

“ Вы уверены, что ваш корабль может входить и выходить незамеченным?”
“Мы не зря называем его Ghost . “

– Ян Додонна и Гера Синдулла ^[src]

Ghost был модифицированным легким грузовым судном VCX-100, принадлежавшим тви’леку Гере Синдулла, который использовался повстанческой ячейкой Спектров в Эпоху Империи. В рамках восстания Ghost участвовал в многочисленных миссиях и сражениях против сил Галактической Империи. Ghost также имел вспомогательное судно под названием Phantom , которое могло использоваться как шаттл, так и как истребитель.После уничтожения Phantom на станции Reklam Spectre получили новый шаттл в виде транспортного шаттла Phantom II класса Sheathipede .

Описание

Схема Ghost .

Ghost был модифицированным легким грузовым кораблем VCX-100, первоначально произведенным Corellian Engineering Corporation. Он был назван Герой ^[4] из-за ее способности уклоняться от имперских датчиков.Несмотря на то, что это старое судно с несколькими шрамами от воздушных боев от Империи, оно все равно работало надежно. Корабль имел место наводчика в носовой башне под секцией кабины, со специальным сиденьем для наводчика и спинную башню с лазерной пушкой на 360 градусов на миделе. Всего было четыре основных грузовых трюма. Судно имело отсек для экипажа в передней части, а два обращенных вперед грузовых трюма составляли передние углы судна. ^[44]

Корабль Ghost был оборудован стыковочными кольцами как с левого, так и с правого борта, как и большинство лёгких грузовых кораблей Corellian.При отсутствии носового стрелка пилот мог управлять носовой башней из кабины. Кроме того, спинной турелью можно было управлять из кабины через гнездо для астромеханического дроида, ^[12] или с помощью набора органов управления на сиденье пилота. ^[10] За кабиной находилась каюта экипажа, состоящая из четырех личных комнат. Рядом с двигателями находились два обращенных назад основных грузовых трюма, которые составляли задние углы корабля. ^{[1] [44]}

У Ghost были двигатели с перегородками, гасители энергии и статические глушители, затрудняющие обнаружение.Эти особенности и более восьмидесяти семи незаконных обновлений стелс-систем Ghost позволили грузовому судну имитировать солнечные колебания или космическое излучение на многих датчиках. ^{[45] [46]} У Ghost было достаточно передовой огневой мощи, чтобы уничтожить командирский крейсер класса Arquitens . ^[32] Во время использования корабля в рамках раннего восстания против Империи, его капитан Гера Синдулла несколько раз сбегал от Имперских войск, активировав свой гипердвигатель, не прокладывая путь с помощью бортового навигационного компьютера корабля, полагаясь на удачу, чтобы избежать столкновения. астероиды или сверхновые.Дроид-астромеханик C1-10P «Чоппер» часто вступал в споры с навигационным компьютером Ghost при отправке ему команд, при этом Ghost находил дроида очень грубым и напористым. ^[45]

На крыше корабля в задней части находился вспомогательный истребитель серии VCX под названием Phantom . Этот универсальный корабль выполнял двойную функцию – как истребитель и шаттл, так и тройной – как кормовой пушечный вооружение Ghost при стыковке хвостом вперед. ^[6] Хотя Phantom был уничтожен во время миссии на Станцию ​​Reklam, ^[28] Призраки заменили его Phantom II , транспортным шаттлом класса Sheathipede , захваченным во время миссии на Агамар. ^[47]

История

Эпоха Империи

До восстания

“ Пойдем куда-нибудь. ”

―Канан Джаррус при первом входе в Ghost ^[src]

По крайней мере, за шесть лет до укрытия Призраков и через восемь лет после провозглашения Нового Порядка, Призрак окажется во владении Геры Синдуллы, идеалистической дочери лидера тви’лекского сопротивления Чама Синдуллы и лидера обоих Сопротивление тви’леков и свободное движение Рилота.Гера, ее дроид-астромеханик C1-10P и ее звездолет Ghost будут путешествовать по галактике, чтобы встретиться с политическими активистами и инакомыслящими против Империи в надежде в конечном итоге сформировать движение сопротивления в далеком будущем. Случайно встретившись с пережившим Великую чистку джедаев Калебом Думом, известным как Кэнан Джаррус, во время событий конфликта с Горсом, эти двое в конечном итоге спасли планету и ее луну Синду. ^[4] Спустя какое-то время после событий конфликта Ghost станет домом для бывшей студентки Имперской академии Сабины Рен и бывшего капитана Высокого почетного караула Ласана Гаразеба Оррелиоса и начнет кампанию антиимперских действий. о далеком земледельческом мире Лотала. ^[48]

Призраки

Ghost выполняет «22 пикапа» на Кесселе

Примерно в это же время команда приступила к выполнению ряда миссий, обычно на Лотале. Во время одного из таких ограблений Джаррус и Синдулла решили совершить набег на имперский конвой с припасами. Однако их преследовали несколько истребителей космического превосходства TIE / ln, и в разгар боя щиты Ghost были отключены. В то время как Чопперу было приказано их отремонтировать, команда заметила, что связь была отключена, и Чоппера снова попросили исправить.Однако Джаррус отменил приказ и сказал дроиду сосредоточиться на щитах. Во время боя Джаррусу удалось уничтожить один из преследовавших их TIE истребителей с помощью спинной башни, а Синдулла, пилотировавший Ghost , смог маневрировать за другим и уничтожить его с помощью передних пушек. Затем Чоппер взял под свой контроль пушки Phantom и использовал их для уничтожения последней. ^[9]

Во время другой такой миссии, Ghost был захвачен, и ему нужно было сбежать от имперцев на Лотале.Рен проник на авиабазу с позывным Spectre Five. Она смогла развернуть красящую бомбу, позволив Ghost ускользнуть незамеченным. ^[49] Чувствительный к Силе сирота Лотала Эзра Бриджер позже присоединился к команде, после чего он заработал свое место среди команды, когда помог им спасти нескольких вуки из пряных шахт Кесселя. ^[12] Ghost затем отправился на планету Гарел, где Призраки украли партию ионных дизрапторных винтовок Т-7 из Империи для продажи криминальному лорду и торговцу черным рынком Цикатро Визаго.Затем Ghost встретились с Tantive IV , чтобы вернуть R2-D2 и C-3PO их владельцу. ^[13]

Захват империи на Лотале

“ Это мой корабль, который вы разрушаете, и я хочу, чтобы вы с него спрятались! ”

―Гера Синдулла ^[src]

Эзра тренируется на борту Ghost

Живя на борту Ghost , Эзра делил комнату с Зебом, и они часто ссорились друг с другом.После битвы Гера послала Эзру и Зеба купить фруктов Мейлоорун в лоталийском городе Котал. Столкнувшись с имперскими путями, эти двое украли истребитель TIE и отправились в небольшое приключение. Предположительно уничтожив истребитель, Эзра и Зеб вернулись к Ghost как друзья. ^[42]

Позже Кэнан дал Эзре свой первый урок джедая, когда Ghost парил над небесами Лотала. Поскольку Эзра не мог сосредоточиться, он чуть не рухнул насмерть.После этого урока Ghost отправился на планету Стигеон Прайм, где мастер-джедай Луминара Ундули предположительно была заключена в укрепленную тюрьму под названием Шпиль. Пока Чоппер ждал на борту Ghost , Кэнан и другие повстанцы прилетели на планету на Phantom . Однако это оказалось ловушкой, расставленной Великим инквизитором, и повстанцы чудом спаслись жизнью. ^[50]

После своего приключения на Стигеон Прайм, Гера и Кэнан совершили набег на Ghost против конвоя из крейсеров класса Gozanti , перевозивших большой кибер-кристалл.В то время как Гера летела на Ghost и атаковала крейсер с кристаллом, Кэнан летал на Phantom и отвлекал эскорт истребителей TIE. Гере и Кэнану помогал Эзра, который проник в Академию молодых имперцев в столице Лотала. Позже Ghost встретился с остальной частью команды за пределами Столицы, где к ним присоединился чувствительный к Силе кадет по имени Джай Келл. Гера организовала убежище Келла и его матери. ^[14]

Ghost и Phantom , спасающиеся от разрушения имперским конвоем

Позже Ghost принял участие в спасательной операции на астероиде PM-1203 после того, как Гера и Сабина оказались там и окружены огненными породами.У Phantom произошла утечка топлива во время стычки с TIE-истребителями. После эвакуации Геры, Сабины и Phantom повстанцы сбежали в космос. ^[51] В День Империи, Ghost был использован его повстанческой командой, чтобы покинуть столицу Лотала после того, как они сорвали празднование Дня Империи и спасли беглого Цибо, родианца с кибернетическим имплантатом, содержащим жизненно важную информацию об операциях Империи в Лотал. ^[15]

Ghost преследовали TIE-истребители во главе с Инквизитором.Получив некоторое повреждение, кораблю удалось прыгнуть в гиперпространство из-за того, что Цибо передал координаты. Однако Инквизитору удалось установить устройство слежения на Phantom , которое все еще использовалось для Ghost . Чтобы защитить Цибо, Кэнан и Эзра отправились на Phantom и заманили Инквизитора на PM-1203. Между тем, Гера встретила Ghost с таинственным лидером повстанцев по имени Фулкрам, который устроил Цибо, чтобы увести его в подполье. ^[52]

Пока Эзра проходил свои испытания джедаев в скрытом храме джедаев на Лотале, другая команда Призрака ждала на Лотале. ^[53] После испытаний Эзры над джедаями, команда Призрака участвовала в работе «галактического предпринимателя» Лэндо Калриссиана, который с неохотной помощью Эзры украл иглобрюхую свинью у криминального авторитета Азморигана. После побега из Азморигана Ghost пришлось пройти через имперскую блокаду вокруг Лотала.Во время путешествия поросенок вырвался на свободу и вызвал хаос на корабле. Ghost также преследовали несколько TIE-истребителей, но Кэнану удалось их потерять. Приземлившись возле фермы Калриссиана, повстанцы победили Азморигана и его приспешников, которые вернулись, чтобы отомстить. ^[16]

Присоединение к более широкому восстанию

Призрак сбегает с Мустафара с помощью эскадрильи «Феникс»

После захвата Кэнана Джарруса Империей Гера находилась на борту «Призрака », когда она получила инструкции от Фулькрама не подвергать опасности остальную часть повстанческой ячейки, спасая Кэнана. .Вопреки приказу Геры Эзра вместе с Чоппером, Сабиной и Зебом отправился на миссию по выяснению местонахождения Кэнана. Пока Чоппер отвлекал Геру, трое других повстанцев сбежали на Phantom . Встретив Визаго, повстанцы узнали, что Кэнан был заключен в тюрьму на борту «Звездного разрушителя Sovereign гранд-моффа Таркина», который летел в систему Мустафар. ^[54] Поскольку Ghost был знаком имперским властям, повстанцы вместо этого использовали украденный грузовой корабль Gozanti , чтобы добраться до Мустафара. ^[17]

Спасательная миссия была успешной, и Призракам удалось убить Великого Инквизитора и уничтожить Sovereign , вынудив Таркина эвакуировать корабль. Позже Ghost снова появился в системе Мустафар с двумя участниками блокады повстанческой сети. В спинной башне Ghost находился Фулькрам, который на самом деле был бывшим падаваном Асокой Тано. ^[55] После того, как Асока схватила Кэнана и его товарищей-повстанцев, она раскрыла свою личность остальной части команды Ghost и подтвердила, что они действительно были частью более крупного Восстания. ^[17]

После событий в системе Мустафара Эзра, Сабина и Зеб использовали Ghost в успешной миссии по спасению сестры своего союзника Заре Леониса Дхары Леонис из нулевой зоны в Арканисе. ^[56] Позже экипаж Ghost присоединился к Phoenix Cell, который управлял флотом звездолетов. Когда повстанцы согласились спасти дезертировавшего имперского министра по имени Макет Туа, ее команда оставила ее с флотом Феникса, поскольку их корабль был знаком имперским властям на Лотале.Их миссия по спасению Туа провалилась, поскольку агент Каллус организовал ее убийство и подставил Призраков. После побега от Дарта Вейдера команда Ghost решила никогда не возвращаться в Лотал, чтобы не подвергать опасности своих людей. ^[19]

Когда Дарт Вейдер догнал их и атаковал флот Феникса, Призрак участвовал в защите флота Феникса. Усовершенствованный истребитель TIE Вейдера уничтожил флагман повстанцев Phoenix Home и несколько истребителей A-wing; заставляя повстанцев отступить в гиперпространство.Во время боя Асока была на борту Ghost , когда она поняла, что Вейдер был ее бывшим наставником Энакином Скайуокером. За Вейдером следовали два Звездных Разрушителя, которые чуть не захватили Ghost в своем проекторе притягивающего луча. Однако грузовому кораблю удалось совершить прыжок в гиперпространство в самый последний момент. ^[19]

Члены эскадрильи Phoenix

Призрак был использован при спасении Дхары Леониса

Поиск новых союзников

После почти полного уничтожения эскадрильи «Феникс» восстание столкнулось с нехваткой баз и сооружений.Асока отправила команду Ghost в пустынный мир Силос, чтобы связаться со своим старым другом, бывшим капитаном клоном Рексом. В то время как Кэнан вместе с Эзрой, Сабиной и Зебом спустился на Силос, Гера и Чоппер остались на борту Ghost , чтобы отремонтировать корабль. Повстанцам удалось установить контакт с Рексом и его товарищами Вольфом и Грегором. Кэнану удалось завоевать доверие Рекса и Грегора, но Вольф не доверял повстанцам и тайно предупредил агента Каллуса и адмирала Кассиуса Константина. ^[57]

Гера и Чоппер были на борту Ghost , когда адмирал Константин и звездный разрушитель Каллуса Relentless покинули гиперпространство над Селосом. Чтобы избежать обнаружения, Гера отключила все системы корабля. Это позволило Ghost избежать захвата. Relentless был вынужден уйти из системы Seelos после того, как Вейдер приказал кораблю встретиться с шаттлом, несущим Инквизитора. Этот уход позволил повстанцам и клонам победить силы шагающих AT-AT агента Каллуса и сбежать за пределы мира на борту Ghost .Таким образом, сеть повстанцев не только нашла новые базы, но и приобрела новых союзников. ^[20]

Во время одного из уроков обучения джедаев Эзры на борту Ghost Сабина и Чоппер разыграли Эзру, прижав ноги Чоппера к металлическому полу корабля. Несмотря на все усилия Эзры, он не смог использовать Силу, чтобы левитировать дроида-астромеханика. ^[58] Когда эскадрилья «Феникс» отправилась на миссию в Ринн, Эзре и Чопперу было приказано остаться и очистить Ghost .Однако два повстанца отправились с несанкционированной миссией на борту Phantom после получения сигнала бедствия от Vizago над Гарелом. ^[59]

Призрак позже участвовал в неудавшейся попытке флота повстанцев Феникса прорвать имперскую блокаду вокруг Ибаара. Повстанцы-Феникс хотели доставить гуманитарную помощь ибарцам, которые страдали после того, как Империя конфисковала их пайки и удвоила их рабочую норму. Повстанцы «Феникс» потеряли своего командира и транспортный корабль.Позже экипаж Ghost принял участие в миссии, чтобы связаться с Куорри, инженером-затворником из Мон-Каламари, живущим на Шантиполе, который разработал новый прототип тяжелого истребителя, известного как крыло Blade. Из-за опасных атмосферных условий Шантипола Ghost оставался в космосе, в то время как Гера, Зеб и Сабина отправились на Ибаар на Phantom . ^[21]

Позже Кэнан, Эзра и Чоппер отправились на встречу с транспортным кораблем на Ghost и собрали припасы для второй попытки прорвать имперскую блокаду вокруг Ибаара.Из-за своего меньшего размера и маневренности Ghost был обозначен как новый транспортный корабль, который попытается прорвать блокаду. Поскольку бедственное положение ибаарцев было ужасным, Кэнан не смог дождаться Геры и ушел, чтобы воссоединиться с флотом. Когда Ghost готовился к запуску в блокаду, Кэнан и его команда получили сообщение от Геры, в котором им говорилось оставаться на своих местах. Вскоре после этого из гиперпространства вышел Phantom , перетащив Blade Wing пополам.Пилотируя Blade Wing, Гера уничтожила лёгкий крейсер класса Imperial Arquitens . Это расчистило путь для Ghost , чтобы доставить гуманитарную помощь ибарцам по воздуху. После миссии на Шантиполе Гера была повышена до лидера Феникса. ^[21]

В бегах

Призрак убегает от звездного разрушителя над Гарелем

Перед битвой при Гареле Эзра спал на своей койке, когда он получил видение Силы своих родителей Эфраима и Миры Бриджер.Затем он убедил Геру и Кэнана подготовиться к отъезду в Лотал, чтобы найти его родителей. Вскоре после этого Сабина Рен наблюдала за системами Ghost , когда ее компьютеры обнаружили имперский флот, отправлявшийся из Лотала в неизвестную экспедицию. Вскоре после этого эскадрилья «Феникс» была атакована имперскими войсками, в том числе наземными войсками, звездными разрушителями и истребителями TIE. После того, как к нему присоединились Зеб и Чоппер, Ghost поднялся в небо над Гарелом. ^[23]

По приказу лидера Феникса Геры другие корабли повстанцев следовали за Ghost . Во время боя Эзра, Кэнан и Чоппер отправились на борту Phantom , чтобы продолжить свои поиски родителей Эзры. После того, как корвет Liberator командира Джун Сато был захвачен проектором притягивающего луча Звездного разрушителя, Гера использовала Ghost , чтобы предпринять опасный маневр, чтобы сбить притягивающий луч Звездного разрушителя.Несмотря на то, что ее фронтальные лазерные пушки были отключены имперским взрывом, Гере все же удалось протаранить проектор. Зеб, который управлял задней башней, едва избежал столкновения с проектором. Освободив корвет Сато, Гера и другие корабли повстанцев скрылись в гиперпространстве. ^[23]

После побега из Гарела сенатор Бейл Органа послал свою приемную дочь принцессу Лею Органу, чтобы доставить три корвета «Сфирна» класса «Молот» повстанцам Феникс.Поскольку альдераанцы не могли напрямую отправлять корабли к повстанцам в космосе, Органы организовали доставку корветов в Лотал, имперский мир. В рамках плана повстанцы «украли» корабли, пока принцесса Лея выполняла «миссию милосердия» в Лотале. Экипаж Ghost был отправлен на встречу с Леей и «украсть» корветы Hammerhead. Однако они столкнулись с неожиданным препятствием, когда имперский магистр снабжения Йогар Листе прикрепил к кораблям гравитационные замки. ^[24]

Призраку удалось встретиться с Кэнаном, Эзрой, Чоппером и Леей в пустыне Лотала. Они также столкнулись с Райдером Азади, бывшим губернатором Лотала, которого они спасли от повторного захвата имперским патрулем. Ghost впоследствии использовался во время успешной операции по краже корветов Hammerhead с имперского склада недалеко от города Джалат. С Герой у штурвала корабля Ghost преследовал шагоходов AT-AT гарнизона, в то время как другие повстанцы отключили гравитационные замки и вывели корветы в космос.Получив корветы, Ghost покинул Лотал и воссоединился с флотом повстанцев в космосе. ^[24]

Рейды и ловушки

Ghost путешествует через коллапсировавшее звездное скопление к Лира Сан

После того, как Эзра получил наводку от пирата Викуэя Хондо Охнака, команда Ghost отправилась в Никсус-Хаб 218, чтобы спасти двух беженцев, захваченных в плен. Галактическая Империя. Эти беженцы оказались Гроном и Хава, двумя беженцами из ласат, которые пережили падение Ласана.После спасения беженцев и бегства от Никсуса, Ghost отправился в легендарное Ласатское убежище Лира Сан, которое находилось в Диком Пространстве. Лира Сан была отделена от остальной галактики коллапсирующим звездным скоплением. Во время экспедиции Зеб использовал свою винтовку, чтобы безопасно пройти Ghost через звездное скопление. Затем они высадили двух беженцев на Лира Сан, которая, как они выяснили, была изначальной родиной ласат. ^[25]

Из-за того, что у Ghost осталось мало топлива и энергии, экипаж Ghost принял участие в ограблении газоперерабатывающего завода астероидного пояса горной гильдии, чтобы добыть топливо для своего корабля и флота.На пути к планетоиду, на котором расположен нефтеперерабатывающий завод, Ghost был окружен несколькими пурргиловыми, большими космическими существами, способными путешествовать через гиперпространство. Экипаж Ghost позже пришел на помощь пурргилу, когда на них напали два истребителя TIE / MG Mining Guild. С помощью пурргила повстанцам удалось украсть несколько канистр с горючим и разрушить завод. Затем Ghost присоединились к пурргилю в их гиперпространственных путешествиях. ^[10]

Призрак позже принял участие в миссии с эскадрильей «Феникс» по краже припасов у Империи.Одному из корветов повстанцев «Хаммерхед» удалось перебросить часть груза на борт Ghost через его стыковочное кольцо. В то же время корабли повстанцев подверглись атаке со стороны Имперского звездного разрушителя и нескольких TIE-истребителей. Один из истребителей А-крыла эскадрильи «Феникс», «Феникс-2», был поражен вражеским огнем, и его гипердвигатель был поврежден. Phoenix Two попыталась состыковать свой корабль с Ghost , но была поражена вражеским огнем. В результате Гера и Кэнан с одобрения командира Сато приняли участие в миссии по похищению имперского авианосца над Рилотом.Позже Ghost организовал встречу между Призраками и Движением Чама за Свободный Рилот. ^[60]

Призрак также принял участие в миссии по исследованию имперского строительного модуля над Джеонозисом. В то время как Гера вместе с Чоппером и Рексом оставались на борту корабля, Кэнан и другие повстанцы рискнули войти в комплекс. Вскоре они попали в засаду имперских штурмовиков во главе с Каллусом, вечным противником повстанцев. Сам Ghost был атакован несколькими ходунками All Terrain Defense Pod.После борьбы большинству повстанцев, кроме Зеба, удалось отступить к Ghost . Ghost преследовали несколько TIE-истребителей, но сумели потерять их, пролетев через один из строительных модулей, в результате чего TIE-истребитель столкнулся с шагоходом AT-DP. Позже Ghost использовался для поиска и спасения Зеба. Им удалось отследить его транспондер до ледяной луны Бахрина, где он и Каллус сформировали маловероятную дружбу, чтобы пережить холод и зверей бонзами. ^[26]

В поисках новой базы

Ghost и корвет Hammerhead, припаркованные на базе Chopper

Несколько месяцев спустя Гера встретила Ghost , чтобы встретиться с Phoenix в глубоком космосе. Кэнан, Чоппер и Эзра только что вернулись с миссии по разведке планеты Осалон в поисках потенциальной базы повстанцев, где они столкнулись с Пятым братом и Седьмой сестрой. Не желая подвергать флот опасности, Кэнан приказал Гере встретиться с ними в глубоком космосе. Ghost также организовал встречу между Тано, Кэнаном и Эзрой. Трое джедаев согласились посетить Храм джедаев на Лотале, чтобы получить ответы от мастера-джедая Йоды о том, как бороться с угрозой, исходящей от инквизиторов. Гера, Сабина и Зеб остались на борту Ghost , в то время как джедаи и Чоппер путешествовали на Phantom в Лотал. ^[61]

Призрак позже принял участие в ограблении с целью украсть топливо из имперского склада на базе Horizon.Группа планировала создать базу в системе Йост, но у нее не было достаточно топлива для поездки туда. В то время как другие повстанцы совершили набег на склад и украли топливо, Чоппер был назначен охранять корабль. Однако его отвлекла нога дроида, продаваемая поблизости, и в результате он оказался в затруднительном положении, когда другие повстанцы были вынуждены поспешно отступить. Затем Ghost вернулся к флоту повстанцев только для того, чтобы найти его под атакой имперских сил под командованием адмирала Константина, который приказал своим TIE-истребителям не позволять Ghost доставлять топливо на истребитель повстанческого флота.Тем не менее, Ghost был спасен благодаря своевременному вмешательству Кецу Оньо, подруги Сабины, которая использовала свой звездолет Shadow Caster для прикрытия. После получения информации от Чоппера и бывшего имперского дроида-инвентаря AP-5 о том, что имперцы устроили ловушку в системе Йост, повстанцы вместо этого отправились на планету Атоллон, на которой не было имперского присутствия. ^[27]

После открытия Атоллона повстанцы Феникс основали на планете базу под названием База Чоппер. Ghost помогал в строительстве базы, перебрасывая припасы с флота повстанцев. После переправы партии генераторов на базу Чоппер Ghost был припаркован рядом с корветом класса Sphyrna . Позже Ghost принял участие в миссии по спасению Сабины и Рекса после того, как на них напали несколько паукообразных существ по имени крикна. Сабина и Рен посетили северный периметр после исчезновения лейтенанта повстанцев Дайсера.Во время попытки спасения Ghost оказался в ловушке под крикной паутиной, но повстанцам удалось вырваться из нее с помощью своих световых мечей. После стычки Ghost сбежал обратно на базу Чоппер. На следующий день повстанцы возвели по периметру забор, состоящий из сенсорных маяков, для защиты базы от крикны. ^[62]

Призрак оставался на базе Чоппера на время миссии Кэнана, Эзры, Асоки и Чоппера на Малакор.После того, как Эзра, Кэнан и Чоппер вернулись из экспедиции, Призраки были на борту Ghost , примиряясь с потерей Асоки и ослеплением Кэнана от рук лорда ситхов Мола. В личных покоях Эзры на борту корабля молодой джедай получил доступ к голокрону ситхов, который он получил в Храме ситхов на Малакоре. ^[63]

Тень Мола и Трауна

Призраки сражаются с Молом в грузовом отсеке Ghost

За два года до битвы при Явине Ghost участвовал в миссии по спасению Хондо Охнака из Имперской тюрьмы на Нараке.Пока Гера ждала на борту Ghost , Эзра и его команда проникли в тюрьму и освободили Хондо и его сокамерника Тербу, которые были убиты во время попытки побега. Из-за присутствия имперских войск и гористой местности Гера предприняла «44 совка» по предложению Эзры, и повстанцы вместе с Хондо запрыгнули на корабль. Позже Эзра проконсультировался со своим голокроном ситхов в своей комнате на борту Ghost . Во время миссии на станцию ​​Реклам Гера и Кэнан использовали Ghost , чтобы спасти Эзру с разрушающейся орбитальной свалки. Ghost и линейные крейсера Phoenix затем скрылись на своих украденных истребителях Y-wing в гиперпространство. ^[28]

Позже Мол захватил Ghost и его команду, включая Геру, Чоппера, Зеба и Сабину. Затем Мол попытался заставить Кэнана и Эзру передать ему голокрон ситхов, а также голокрон Джарруса в обмен на безопасное возвращение их друзей. Затем Мол заставил Синдуллу совершить экскурсию по Ghost и показать ему апартаменты Джарруса.Там он нашел голокрон джедаев и безуспешно попытался его открыть. Затем команда попыталась подчинить Мола, но потерпела неудачу. Ghost затем отправился к заброшенному мандалорскому форпосту Vizsla Keep 09, где у Мола была база. Позже Мол отдал своему модифицированному дроиду-гиду приказ казнить заключенных в грузовом отсеке Ghost . Однако их остановил Кэнан. ^[29]

Из-за связи Ghost с восстанием, смоделированная версия корабля появилась во время учений в элитной Академии Skystrike.Капитан Вулт Скеррис использовал одну из таких симуляций, чтобы научить Веджа Антиллеса и агента повстанцев под прикрытием Сабин Рен, как важно выполнять приказы. Позже Гера и Призраки использовали Ghost для снабжения движения Free Ryloth. После спасения ее отца и повстанческого борца Нумы, две повстанческие ячейки объединили свои силы в неудачной миссии по возвращению артефакта под названием Каликори у гранд-адмирала Трауна. Несмотря на то, что повстанцам не удалось найти объект, повстанцам удалось избежать ловушки, устроенной заместителем командира Трауна капитаном Славиным, и сбежать на борту Ghost . ^[30]

Призрак позже доставил Призраков и Рекса на планету Агамар с миссией по спасению протонных бомб с потерпевшего крушение корабля снабжения сепаратистов. Гера и Сабина отправились на «Призраке » и совершили набег на Имперский склад горючего. Они избежали заговора губернатора Прайса, чтобы поймать их, но остались в космосе, ожидая дальнейших сообщений от Рекса и других повстанцев. Тем временем другие повстанцы объединили свои силы с оплотом сепаратистов во главе с супер-тактическим дроидом Калани, чтобы спастись бегством от имперских войск.Позже Гера восстановила контакт с Рексом и Кэнаном, которые сообщили, что нашли Ghost новым транспортным средством: Phantom II . ^[47]

Призрак был частью сил эскадрильи Феникс, которая отправилась на Микапо, чтобы эвакуировать сторонников мятежников перед имперскими репрессиями. Ghost ненадолго участвовал в воздушном бою с Имперскими TIE-истребителями. После стычки Гера состыковала Ghost с Sato’s Hammer , легким грузовым судном YT-2400, в котором находилась ячейка повстанцев, называвшая себя Железной эскадрильей.Не сумев убедить Железную эскадрилью покинуть Микапо до прибытия имперских подкреплений, Гера забрала Ghost назад, чтобы присоединиться к флоту повстанцев. Эзра, Сабина и Чоппер остались на Phantom II в попытке победить Iron Squadron. Позже Ghost принял участие в стычке с имперскими войсками под командованием адмирала Константина и сумел переправить капитана Железной эскадрильи Марта Маттина и его корабль в безопасное место. Ghost также пролетел над командирским крейсером Konstantine Arquitens класса , что позволило Марту сбросить бомбу на корабль. Ghost и остальная часть эскадрильи «Феникс» затем скрылись в гиперпространстве, когда гранд-адмирал Траун прибыл на имперском звездном разрушителе. ^[8]

Винкахту и Джеонозис

Ghost во время эвакуации груза Hondo Wynkahthu

Spectre позже использовали Ghost для встречи с переоборудованным имперским десантным кораблем Hondo. Хондо и его новому деловому партнеру Азморигану удалось убедить повстанцев помочь им извлечь сокровища с имперского грузового корабля, застрявшего в бурных верхних слоях атмосферы планеты Винкахту.Хондо удалось убедить повстанцев помочь им, указав на наличие протонных бомб, товара, необходимого для восстания. Гера и Кэнан летали на Ghost , в то время как другие повстанцы поднялись на заброшенный грузовой корабль. После опасной миссии повстанцам и их союзникам удалось заполучить сокровища и оружие, прежде чем они разошлись. ^[31]

После разведывательной миссии, предпринятой Эзрой, Кэнаном, Чоппером и ячейкой повстанцев Азади с целью украсть планы новой инициативы Трауна по истребителям, Гера собрала ударную группу для атаки Имперского Оружейного комплекса на планете Лотал.Прежде чем миссия могла продолжаться, Эзра поддался видениям Силы, созданным Молом. Позже Эзра проснулся в своей каюте на Ghost и настаивал, что все в порядке. Однако Эзра был освобожден от своей роли в миссии после того, как он чуть не убил солдата повстанцев, которого он принял за Мола. По совету Канана Гера отправилась на Ghost , чтобы возглавить атаку на фабрику Lothal Imperial. ^[65]

Позже Спектры и Рекс отправились на «Призраке » на Джеонозис, чтобы найти Со Герреру, который отправился на миссию по расследованию очевидного исчезновения джеонозийцев.Пока Кэнан, Эзра, Чоппер и Рекс исследовали джеонозианскую структуру, а Сабина и Зеб отправились исследовать ближайший генератор дефлекторного щита, Гера осталась на борту Ghost , чтобы присматривать за кораблем. После того, как команда Кэнана нашла Со, а джеонозианец по имени Клик-Клак, а Сабина и Зеб получили дефлекторное ядро, Ghost сбил два имперских TIE-бомбардировщика, которые были отправлены с командирского крейсера класса Arquitens капитана Брансона. ^[32]

Затем Гера запустила Ghost в воздушную шахту, чтобы встретиться с командой Кэнана.После того, как команда Кэнана и Пила, между Спектрами, Рексом и Пилой вспыхнул спор по поводу жестоких методов допроса Клик-Клака. Затем повстанцы объединили свои силы, чтобы отбить имперский абордаж десантников, когда Ghost скрылся в глубинах Джеонозиса. Оказавшись под землей, повстанцы обнаружили несколько канистр с ядом, которые доказали, что Империя совершила геноцид против джеонозианцев. Позволив Клик-Клаку сбежать в глубины Джеонозиса с яйцом джеонозийской королевы, повстанцы использовали Ghost , чтобы пробиться из воздушной шахты, прежде чем легкий крейсер Брансона смог разрушить конструкцию на их вершине. Ghost также повредил имперский корабль протонными торпедами перед тем, как улететь в космос. ^[32]

Ghost позже принял участие в учениях с другими элементами эскадрильи Phoenix. Позже корабль вернулся на базу Чоппер после того, как Гера получила сообщение от Зеба о попытке имперского проникновения. ^[66] Позже Фенн Рау посетила Канан, чтобы обсудить важность Темного меча, древнего мандалорского символа лидерства и власти.Фенн, Кэнан и Гера считали, что Сабина может научиться владеть оружием и привести мандалорцев к восстанию. Во время встречи в общей комнате корабля Сабина неохотно согласилась принять вызов лидерства и сражения. ^[67]

Вступление в Альянс

Ghost , переправляющий Мон Мотму через туманность Археон

Позже капитан Гера, Эзра, Зеб и Чоппер отправили Ghost в глубокий космос, чтобы встретиться с другой группой повстанцев, которая оказалась бывшим имперским сенатором Мон Мотма и золотая эскадрилья Y-wing. Ghost также уничтожил имперскую тактическую капсулу проникновения, но не смог остановить дроида-разведчика серии E-XD от предупреждения Империи. ^[33] После стыковки с шаттлом Mothma Taylander Chandrila Mistress , ^[68] экипаж Ghost приступил к заправке нескольких истребителей Y-wing. Ghost и Золотая эскадрилья были тогда вовлечены в стычку с имперским легким крейсером и крейсером Gozanti . ^[33]

После эвакуации Мотмы и ее команды с разбитого корабля, Ghost и Золотая эскадрилья прошли через опасный перевал Археон, пытаясь добраться до Дантуина.Во время путешествия Ghost и сопровождающие его Y-крылья были атакованы прототипом TIE Defender. Ghost также получил некоторые повреждения корпуса из-за интенсивного излучения туманности Археон. После выхода из туманности Ghost был перехвачен двумя имперскими звездными разрушителями под командованием губернатора Прайса и адмирала Константина. Повстанцам удалось освободить Ghost от тягового луча звездного разрушителя Прайса, когда Гера убедила Золотого лидера Джона Вандера и Эзру запустить свои протонные торпеды в туманность.Достигнув Дантуина, Мон Мотма произнесла речь, объявляя о создании Альянса за восстановление Республики на борту Ghost . Вскоре к Ghost присоединился флот повстанцев. ^[33]

После формирования Альянса повстанцев Гера вместе с Эзрой и Зебом остались на борту Ghost , в то время как Чоппер улетел с AP-5 и Веджем Антиллесом с секретной миссией по краже разрешительных кодов у Имперского бюро безопасности. станции на Киллун 71 для предстоящей атаки на Лотал.В ходе миссии Чоппер был угнан командой имперских слайсеров, базировавшейся на борту крейсера Gozanti , которые хотели найти местонахождение базы Чоппер. Угнанный Чоппер запер свою команду в грузовом отсеке Ghost и попытался подвергнуть их воздействию невесомости. ^[34]

Чоппер также установил всплеск данных в навигационный компьютер Ghost . Прежде чем имперцы смогли закончить загрузку данных, AP-5 удалось вскрыть грузовой отсек снаружи.Несмотря на то, что Чоппер отправил AP-5 в космос, Спектрам и Веджу удается вернуть корабль и восстановить исходную программу Чоппера. В отместку за ранение своего дроида Гера загрузила имперский крейсер большим объемом данных, в результате чего корабль взорвался. Отремонтировав Чоппер, повстанцы спасли АП-5, укрывшийся в космосе. ^[34]

За Атоллоном

«Призрак » , спасающийся от имперской блокады Атоллона

ГОСТ и JAS, в чем разница между ними?

Мы писали о различных формулах измерения ранее в нашем блоге. На этот раз мы сосредоточимся на двух очень важных: JAS и ГОСТ, которые наиболее широко используются в международной торговле. С Timbeter легко проверять объемы по обеим формулам.Мы провели небольшой эксперимент и продемонстрировали, как различаются объемы.

JAS был разработан в Японии для измерения круглого леса и основан на самой формуле. ГОСТ 2708-75 (расшифровывается как «Государственный стандарт – Круглый лес, таблица объемов») был создан в Советском Союзе и использует фиксированные значения для определенных диаметров, которые взяты из таблиц. Также интересно отметить, что существует таблица ГОСТов для множества различных стандартов, которые вы можете себе представить, от мясных консервов до требований к чертежам.2 * (л / 10000)

D – диаметр малого конца (см), для диаметра менее 14 см округляется в меньшую сторону, а после 14 см диаметр округляется до ближайшего четного целого числа.
L – Длина (м)
L ’- длина в метрах с округлением до ближайшего целого числа

Для бревен должно быть измерено менее 14 см (номинально) на малом конце через узкую ось.

Для бревен размером 14 см и более необходимо провести два измерения: по узкой оси и по широкой оси конца бревна.

Для ГОСТ 2708 75, вы можете найти полную таблицу здесь .

Разница диаметров скругления

В случае JAS необходимо соблюдать следующие правила округления: для бревен менее 14 см диаметр округляется в меньшую сторону, а для бревен более 14 см диаметр округляется в меньшую сторону до ближайшего четного целого числа.

По ГОСТу диаметры округляются до ближайшего сантиметра (12,51 оборота до 13 см и 12,49 оборота до 12 см).Диаметр более 14 см округляется до ближайшего четного числа (24,9 округляется до 24 см; 25,1 округляется до 26 см).

Timbeter отображает на экране точный диаметр с точностью до одного десятичного знака (25,9 см), но на листе учета число уже округлено в меньшую сторону в соответствии с требованиями (24 см в случае JAS). Так что всякий раз, когда возникает вопрос, каков точный диаметр бревна, это легко проверить. Средний диаметр также рассчитывается на основе округленных диаметров.

Объемы

Если мы измеряем груду бревен с помощью JAS, результат будет 44,07 м³, а средний диаметр – 14,76 см.Если использовать ГОСТ, то результат будет 43,67. По ГОСТу средний диаметр 15,51 см.

Итак, результаты не сильно отличаются друг от друга, но все же могут повлиять на большие объемы. Это различие связано с тем, что бревна измеряются по-разному, в соответствии с их собственными формулами (или таблицами в случае ГОСТа). Таким образом, цифры имеют очень небольшие различия, но пользователь все равно может столкнуться с ними как с исходящими непосредственно от способа измерения журналов.

Заинтересованы в самостоятельном тестировании различных формул? Загрузите Timbeter отсюда.

Анализ функционального обогащения списка генов и преобразование пространства имен с помощью gprofiler2

Анализ обогащения

ГОСТ позволяет выполнять функциональное профилирование списков генов. Функция выполняет статистический анализ обогащения, чтобы найти избыточное представление функций из генной онтологии, биологических путей, таких как KEGG и Reactome, аннотаций болезней человека и т. Д.Это делается с помощью гипергеометрического теста с последующей поправкой на множественное тестирование.

Стандартный ввод функции gost – это (именованный) список идентификаторов генов. Список может состоять из идентификаторов смешанных типов (белков, транскриптов, идентификаторов микрочипов и т. Д.), Идентификаторов SNP, хромосомных интервалов или идентификаторов функциональных терминов.

Параметр организм позволяет определить соответствующий исходный организм для списка генов. Названия организмов обычно создаются путем соединения первой буквы имени и фамилии, e.г человека – hsapiens . Если некоторые из идентификаторов входных генов являются полностью числовыми, параметр numeric_ns позволяет определить соответствующее пространство имен. См. Раздел Поддерживаемые организмы и пространства имен идентификаторов для ссылок на поддерживаемые организмы и пространства имен.

Если входные гены упорядочены по убыванию на основе некоторой биологической важности, то orders_query = TRUE будет учитывать это. Например, гены можно упорядочить в соответствии со значениями дифференциальной экспрессии или абсолютными значениями экспрессии.В этом случае тестирование с возрастающим обогащением выполняется со все большим количеством генов, начиная с верхней части списка. Обратите внимание, что с этим параметром размер запроса может быть разным для каждого функционального термина.

Параметр значимый = ИСТИНА является индикатором того, должны ли возвращаться все или только статистически значимые результаты.

В случае генной онтологии (GO) exclude_iea = TRUE исключит электронные аннотации GO из источника данных перед тестированием.Это термины с кодом свидетельства IEA, указывающие, что эти аннотации назначаются генам с использованием методов in silico curation.

Чтобы измерить недопредставленность вместо избыточного представления, установите measure_underpresentation = TRUE .

По умолчанию user_threshold = 0,05 , который определяет настраиваемый порог значимости p-значения для результатов. Результаты с меньшим значением p помечаются как значимые. Мы не рекомендуем устанавливать его выше 0.05.

Чтобы уменьшить количество ложных срабатываний, к p-значениям обогащения применяется метод корректировки множественного тестирования. По умолчанию используется наш индивидуальный алгоритм g: SCS ( Correction_method = "gSCS" с синонимами g_SCS и аналитический ), но есть также варианты применения поправки Бонферрони ( Correction_method = "bonferroni" ) или FDR ( Correction_method = "fdr" ). Скорректированные значения p представлены в результатах.

Параметр domain_scope определяет способ вычисления статистического размера домена. Это один из параметров гипергеометрической функции вероятности. Если domain_scope = "annotated" , то только гены с хотя бы одной аннотацией считаются частью полного домена. Если domain_scope = "known" , то все гены данного организма считаются частью домена.

В зависимости от вопроса исследования в некоторых случаях рекомендуется ограничить набор домена / фона.Например, можно использовать настраиваемый фон, когда они хотят сравнить список генов с настраиваемым списком экспрессируемых генов. gost предоставляет средства для определения пользовательского фона в виде (смешанного) списка идентификаторов генов с параметром custom_bg . Если используется этот параметр, то для области домена устанавливается значение domain_scope = "custom" . Также можно установить этот параметр на domain_scope = "custom_annotated" , который будет использовать набор генов, аннотированных в источнике данных, а также включенных в предоставленный пользователем фоновый список.

Параметр источники позволяет выбрать интересующие источники данных. По умолчанию анализируются все источники. Доступные источники данных и их сокращения перечислены в разделе [Источники данных]. Например, если sources = c ("GO: MF", "REAC") , то возвращаются только результаты из ветви молекулярных функций генной онтологии и путей из Reactome. Можно также загрузить свои собственные аннотационные данные, которые более подробно описаны в разделе Пользовательские источники данных с upload_GMT_file .

  gostres <- gost (query = c ("X: 1000: 1000000", "rs17396340", "GO: 0005005", "ENSG00000156103", "NLRP1"),
                организм = "hsapiens", заказ_запрос = ЛОЖЬ,
                multi_query = FALSE, значащий = TRUE, exclude_iea = FALSE,
                measure_underpresentation = FALSE, evcodes = FALSE,
                user_threshold = 0,05, Correction_method = "g_SCS",
                domain_scope = "аннотированный", custom_bg = NULL,
                numeric_ns = "", sources = NULL, as_short_link = FALSE)  

Результатом является именованный список , где «результат» - это данные .кадр с результатами анализа обогащения и «мета» , содержащий именованный список со всеми метаданными для запроса.

  имен (гостр)
#> [1] "результат" "мета"  

  голова (gostres $ result, 3)
#> запросить значимое значение p_value term_size query_size correction_size
#> 1 query_1 TRUE 2.737754e-30 88 22 16
#> 2 query_1 ИСТИНА 9.341439e-22 283 22 16
#> 3 query_1 ИСТИНА 9.896007e-22 284 22 16
#> точное повторение term_id source term_name
#> 1 0,7272727 0,18181818 GO: 0048013 GO: Путь передачи сигналов рецептора эфрина BP
#> 2 0,7272727 0,05653710 GO: 0007411 GO: Направление аксона BP
#> 3 0,7272727 0,05633803 GO: 0097485 GO: Управление проекцией нейронов АД
#> effective_domain_size source_order родители
#> 1 18123 14536 GO: 0007169
#> 2 18123 3298 GO: 0007409, GO: 0097485
#> 3 18123 21913 GO: 0006928, GO: 0006935, GO: 0048812  

Результат данных.кадр содержит следующие столбцы:

• запрос - имя входящего запроса, которое по умолчанию является порядком запроса с префиксом «запрос_». Это можно изменить с помощью именованного ввода списка .
• значимый - показатель статистически значимых результатов
• p_value - гипергеометрическое p-значение после коррекции для множественного тестирования
• term_size - количество генов, аннотированных для термина
• query_size - количество генов, которые были включены в запрос.Он может отличаться от размера исходного списка, если:
  1. любые гены были сопоставлены с множественными ID генов Ensembl
  2. какие-либо гены не удалось сопоставить с идентификаторами генов Ensembl
  3. параметр orders_query = TRUE , и оптимальное отсечение для термина было найдено до завершения запроса
  4. для domain_scope было установлено значение «annotated» или «custom»
• correction_size - количество генов во входном запросе, которые аннотированы к соответствующему термину
• precision - доля генов во входном списке, которые аннотированы для функции (определено как correction_size / query_size)
• напоминание - доля функционально аннотированных генов, которые извлекаются запросом (определено как crossction_size / term_size)
• term_id - уникальный идентификатор термина (например,г GO: 0005005)
• источник - сокращение источника данных для термина (например, GO: BP)
• term_name - краткое имя функции
• effective_domain_size - общее количество генов «во вселенной», использованных для гипергеометрического теста
• source_order - порядковый номер термина в его источнике данных (это важно для вывода результатов)
• родителей - список идентификаторов терминов, которые иерархически расположены непосредственно над термином. Для неиерархических источников данных это указывает на искусственный корневой узел.

  имен (gostres $ meta)
#> [1] "query_metadata" "result_metadata" "genes_metadata" "timestamp"
#> [5] "версия"  

Параметры запроса перечислены в части «query_metadata» объекта метаданных. «result_metadata» включает статистику источников данных, которые используются в тестировании обогащения. Это включает «domain_size» , показывающий количество генов, аннотированных для этого домена. «number_of_terms» , указывающее количество терминов, которые g: Profiler имеет в базе данных для этого источника, и номинальное значение «порог» для этого источника. «genes_metadata» показывает особенности генов запроса (неудачные, неоднозначные или повторяющиеся входные данные) и их сопоставления с пространством имен ENSG. Кроме того, в метаданных отображается время запроса и используемая версия данных g: Profiler.

Параметр evcodes = TRUE включает в результаты коды свидетельств. Кроме того, столбец «пересечение» появится рядом с результатами, показывающими идентификаторы входных генов, которые пересекаются с соответствующим функциональным термином.Обратите внимание, что его параметр может снизить производительность и замедлить выполнение запроса.

  gostres2 <- gost (query = c ("X: 1000: 1000000", "rs17396340", "GO: 0005005", "ENSG00000156103", "NLRP1"),
                организм = "hsapiens", заказ_запрос = ЛОЖЬ,
                multi_query = FALSE, значащий = TRUE, exclude_iea = FALSE,
                measure_underpresentation = FALSE, evcodes = TRUE,
                user_threshold = 0,05, Correction_method = "g_SCS",
                domain_scope = "аннотированный", custom_bg = NULL,
                numeric_ns = "", sources = NULL)  

  голова (gostres2 $ результат, 3)
#> запросить значимое значение p_value term_size query_size correction_size
#> 1 query_1 ИСТИНА 2.737754e-30 88 22 16
#> 2 query_1 ИСТИНА 9.341439e-22 283 22 16
#> 3 query_1 TRUE 9.896007e-22 284 22 16
#> точное повторение term_id source term_name
#> 1 0,7272727 0,18181818 GO: 0048013 GO: Путь передачи сигналов рецептора эфрина BP
#> 2 0,7272727 0,05653710 GO: 0007411 GO: Направление аксона BP
#> 3 0,7272727 0,05633803 GO: 0097485 GO: Управление проекцией нейронов АД
#> effective_domain_size source_order родители
#> 1 18123 14536 GO: 0007169
#> 2 18123 3298 GO: 0007409, GO: 0097485
#> 3 18123 21913 GO: 0006928, GO: 0006935, GO: 0048812
#> proof_codes
#> 1 IDA TAS IEA, ISS TAS IEA, TAS IEA, IDA IBA TAS, IGI TAS IEA, ISS TAS IEA, IDA TAS IEA, IDA TAS IEA, IGI ISS IBA TAS IEA, ISS TAS IEA, TAS, IDA TAS IEA, IDA TAS, TAS IEA, IDA TAS IEA, IBA TAS IEA
#> 2 IBA, ISS IBA IEA, IBA, IBA IEA, ISS IBA IEA, ISS IBA IEA, IBA IEA, IBA, IBA, ISS IBA, IBA, ISS IBA IEA, ISS IBA IEA, IBA, IBA, IBA
#> 3 IBA, ISS IBA IEA, IBA, IBA IEA, ISS IBA IEA, ISS IBA IEA, IBA IEA, IBA, IBA, ISS IBA, IBA, ISS IBA IEA, ISS IBA IEA, IBA, IBA, IBA
#> перекресток
#> 1 ENSG00000044524, ENSG00000070886, ENSG00000080224, ENSG00000108947, ENSG00000116106, ENSG00000133216, ENSG00000135333, ENSG00000142627, ENSG00000143590, ENSG00000145242, ENSG00000146904, ENSG00000154928, ENSG00000182580, ENSG00000183317, ENSG00000196411, ENSG00000243364
#> 2 ENSG00000044524, ENSG00000070886, ENSG00000080224, ENSG00000108947, ENSG00000116106, ENSG00000133216, ENSG00000135333, ENSG00000142627, ENSG00000143590, ENSG00000145242, ENSG00000146904, ENSG00000154928, ENSG00000182580, ENSG00000183317, ENSG00000196411, ENSG00000243364
#> 3 ENSG00000044524, ENSG00000070886, ENSG00000080224, ENSG00000108947, ENSG00000116106, ENSG00000133216, ENSG00000135333, ENSG00000142627, ENSG00000143590, ENSG00000145242, ENSG00000146904, ENSG00000154928, ENSG00000182580, ENSG00000183317, ENSG00000196411, ENSG00000243364  

Результат данных.кадр будет включать дополнительные столбцы:

• proof_codes - список всех кодов свидетельств для пересекающихся генов между вводом и термином. Доказательства разделяются запятыми для каждого гена.
  
• пересечение - список генов из запроса, разделенных запятыми, которые аннотированы к соответствующему термину

Результаты запроса также можно собрать в виде короткой ссылки на веб-инструмент g: Profiler. Для этого установите параметр as_short_link = TRUE .В этом случае функция gost () возвращает только ссылку веб-инструмента на результаты в виде строки символов. Например, это полезно, когда вы обнаруживаете интересный результат, которым хотите немедленно поделиться с коллегами. Затем вы можете просто программно сгенерировать короткую ссылку и скопировать ее своим коллегам.

  gostres_link <- gost (query = c ("X: 1000: 1000000", "rs17396340", "GO: 0005005", "ENSG00000156103", "NLRP1"),
                as_short_link = TRUE)  

Этот запрос возвращает короткую ссылку в форме https: // biit.cs.ut.ee/gplink/l/HfapQyB5TJ.

Множественные запросы

Функция gost также позволяет выполнять обогащение по множественным входным спискам генов. Множественные запросы обнаруживаются автоматически, если входной запрос представляет собой список векторов с идентификаторами генов, а результаты объединяются в идентичный data.frame , как в случае одиночного запроса.

  multi_gostres1 <- gost (query = list ("chromX" = c ("X: 1000: 1000000", "rs17396340",
                                                 «GO: 0005005», «ENSG00000156103», «NLRP1»),
                             "chromY" = c ("Y: 1: 10000000", "rs17396340",
                                          «GO: 0005005», «ENSG00000156103», «NLRP1»)),
                       multi_query = FALSE)  

  голова (multi_gostres1 $ result, 3)
#> запросить значимое значение p_value term_size query_size correction_size
#> 1 chromX ИСТИНА 2.737754e-30 88 22 16
#> 2 chromX ИСТИНА 9.341439e-22 283 22 16
#> 3 chromX ИСТИНА 9.896007e-22 284 22 16
#> точное повторение term_id source term_name
#> 1 0,7272727 0,18181818 GO: 0048013 GO: Путь передачи сигналов рецептора эфрина BP
#> 2 0,7272727 0,05653710 GO: 0007411 GO: Направление аксона BP
#> 3 0,7272727 0,05633803 GO: 0097485 GO: Управление проекцией нейронов АД
#> effective_domain_size source_order родители
#> 1 18123 14536 GO: 0007169
#> 2 18123 3298 GO: 0007409, GO: 0097485
#> 3 18123 21913 GO: 0006928, GO: 0006935, GO: 0048812  

Столбец «запрос» в данных результата .фрейм теперь будет содержать соответствующее имя для запроса. Если имя не указано, то имя запроса определяется как порядок запросов с префиксом «запрос_».

Другой вариант для множественных списков генов - установка параметра multiquery = TRUE . Затем результаты всех входных запросов группируются по идентификаторам терминов для лучшего сравнения.

  multi_gostres2 <- gost (query = list ("chromX" = c ("X: 1000: 1000000", "rs17396340",
                                                 «GO: 0005005», «ENSG00000156103», «NLRP1»),
                             "chromY" = c ("Y: 1: 10000000", "rs17396340",
                                          «GO: 0005005», «ENSG00000156103», «NLRP1»)),
                       multi_query = TRUE)  

  голова (multi_gostres2 $ result, 3)
#> term_id p_values ​​значащий term_size
#> 1 GO: 0005005 7.123326e-48, 2.269088e-44 ИСТИНА, ИСТИНА 16
#> 2 GO: 0005003 6.895195e-45, 2.193428e-41 ИСТИНА, ИСТИНА 19
#> 3 REAC: R-HSA-3928665 3.712329e-33, 1.629532e-32 ИСТИНА, ИСТИНА 49
#> query_sizes correction_sizes источник имя_терма
#> 1 23, 32 16, 16 GO: активность трансмембранно-эфринового рецептора MF
#> 2 23, 32 16, 16 GO: активность рецептора эфрина MF
#> 3 20, 21 16, 16 REAC EPH-эфрин-опосредованное отталкивание клеток
#> effective_domain_size source_order родители
#> 1 18679 1536 GO: 0005003
#> 2 18679 1534 GO: 0004714
#> 3 10622753 REAC: R-HSA-2682334  

Результат данных.кадр содержит следующие столбцы:

• term_id - уникальный идентификатор термина (например GO: 0005005)
• p_values ​​ - гипергеометрические p-значения после корректировки для множественного тестирования в порядке входных запросов
• значимые - показатели в порядке входных запросов для статистически значимых результатов
• term_size - количество генов, аннотированных для термина
• query_sizes - количество генов, которые были включены в запрос в порядке входных запросов
• correction_sizes - количество генов во входном запросе, которые аннотированы к соответствующему термину в порядке входных запросов
• источник - аббревиатура источника данных для термина (e.грамм. GO: BP)
• term_name - краткое имя функции
• effective_domain_size - общее количество генов «во вселенной», использованных для гипергеометрического теста
• source_order - порядковый номер термина в его источнике данных (это важно для вывода результатов)
• source_order - порядковый номер термина в его источнике данных (это важно для вывода результатов)
• родителей - список идентификаторов терминов, которые иерархически расположены непосредственно над термином.Для неиерархических источников данных это указывает на искусственный корневой узел.

Визуализация

Основное обновление в этом пакете предоставляет функциональные возможности для создания визуализаций, аналогичных тем, которые теперь доступны в веб-инструменте.

Результаты обогащения визуализируются с помощью графика, подобного Манхэттену, с использованием функции gostplot и ранее найденных результатов gost gostres :

  gostplot (gostres, capped = TRUE, interactive = TRUE)  

Ось x представляет функциональные термины, которые сгруппированы и имеют цветовую кодировку в соответствии с источниками данных и расположены в соответствии с фиксированным «source_order» .Порядок определяется таким образом, что термины, расположенные ближе друг к другу в исходной иерархии, также находятся рядом друг с другом на графике Манхэттена. Исходные цвета настраиваются с помощью параметра pal , который определяет цветовую карту с именованным списком .

Ось Y показывает скорректированные значения p в отрицательной шкале log10. Каждый круг состоит из одного члена и имеет размер в соответствии с размером термина, то есть у больших членов есть большие круги. Если interactive = TRUE , то интерактивный график возвращается с использованием пакета plotly .При наведении курсора на кружок отображается соответствующая информация.

Параметр capped = TRUE является индикатором того, будет ли -log10 (p-values) ограничено 16, если больше 16. Это фиксирует масштаб оси Y, чтобы графики Манхэттена из разных запросов были сопоставимы, а также интуитивно понятен. поскольку статистически меньшие p-значения могут быть суммированы как очень значимые.

Если interactive = FALSE , функция возвращает статический объект ggplot .

  p <- gostplot (gostres, capped = FALSE, interactive = FALSE)
п  

Функция publish_gostplot принимает статический объект графика в качестве входных данных и позволяет выделить ряд интересных терминов из результатов с числами и таблицей результатов. Их можно установить с помощью параметра highlight_terms , в котором перечислены идентификаторы терминов в векторе или как data.frame со столбцом «term_id» , например, подмножество данных результата .рама .

  стр. <- publish_gostplot (p, highlight_terms = c ("GO: 0048013", "REAC: R-HSA-3928663"),
                       ширина = NA, высота = NA, имя файла = NULL)  

Функция также позволяет сохранить результат в файл изображения в форматах PNG, PDF, JPEG, TIFF или BMP с параметром имя файла . Ширину и высоту участка можно отрегулировать с помощью соответствующих параметров ширина и высота .

Если требуются дополнительные графические параметры, такие как увеличенное разрешение, объекты графика можно легко сохранить с помощью функции ggsave из пакета ggplot2 .

Результаты гост также могут быть визуализированы в виде таблицы. publish_gosttable создаст красивую таблицу со статистикой результатов для highlight_terms из результата data.frame . highlight_terms может быть вектором идентификаторов терминов или подмножеством результатов.

  publish_gosttable (gostres, highlight_terms = gostres $ result [c (1: 2,10,120),],
                        use_colors = ИСТИНА,
                        show_columns = c («источник», «имя_терма», «размер_термина», «размер_пересечения»),
                        имя файла = NULL)
#> Ввод "highlight_terms" - это данные.Рамка. Будет использован столбец term_id.  

Параметр use_colors = FALSE указывает, что столбец p-значений не должен выделяться цветом фона. show_columns используется для перечисления имен дополнительных столбцов для отображения в таблице в дополнение к «term_id» и «p_value» .

Те же функции работают и в случае результатов множественных запросов, показывающих несколько графиков Манхэттена друг над другом:

  gostplot (multi_gostres2, capped = TRUE, interactive = TRUE)  

Обратите внимание, что если на одном из графиков Манхэттена щелкнуть термин, он также будет выделен на других (если он присутствует), что позволяет сравнить несколько запросов.Незначительные термины выделены более светлым цветом.

  publish_gosttable (multi_gostres1,
                         highlight_terms = multi_gostres1 $ результат [c (1, 82, 176),],
                        use_colors = ИСТИНА,
                        show_columns = c («источник», «имя_терма», «размер_терма»),
                        имя файла = NULL)
#> Ввод 'highlight_terms' - это data.frame. Будет использован столбец term_id.  

Пользовательские источники данных с

В дополнение к доступным источникам данных GO, KEGG и т. Д. Пользователи могут загружать свой собственный источник данных, используя формат файла Gene Matrix Transposed (GMT).Формат файла описан здесь. Пользователи могут сами составлять файлы или использовать предварительно скомпилированные наборы генов с доступных специализированных веб-сайтов, таких как база данных молекулярных сигнатур (MSigDB) и т. Д. Файлы GMT для источников g: Profiler по умолчанию (за исключением KEGG и Transfac, поскольку мы ограничены источником данных лицензии) можно загрузить из раздела Источники данных в g: Profiler.

upload_GMT_file позволяет загружать файлы GMT. Входные данные gmtfile - это имя файла GMT вместе с путем к файлу.Входными данными также могут быть несколько файлов GMT, сжатых в ZIP-файл. Расширение файла должно быть .gmt или .zip в случае нескольких файлов GMT. Загруженное имя файла используется для определения имени источника в результатах обогащения.

Например, с использованием наборов генов BioCarta, загруженных из коллекций MSigDB.

  download.file (url = "http://software.broadinstitute.org/gsea/resources/msigdb/7.0/c2.cp.biocarta.v7.0.symbols.gmt", destfile = "extdata / biocarta.gmt ")  

  upload_GMT_file (gmtfile = "extdata / biocarta.gmt")  

Результатом является строка, обозначающая уникальный идентификатор загруженного источника данных в базу данных g: Profiler. В данном примере это gp_ _TEXF_hZLM_d18 .

После загрузки этот идентификатор можно использовать как значение для параметра организм в функции гост . Входной запрос должен состоять из идентификаторов, доступных в файле GMT.Обратите внимание, что все гены в файле GMT ​​определяют размер домена, и поэтому недостаточно включить в файл только выборку интересных терминов.

  custom_gostres <- gost (query = c ("MAPK3", "PIK3C2G", "HRAS", "PIK3R1", "MAP2K1",
                                 «RAF1», «PLCG1», «GNAQ», «MAPK1», «PRKCB», «CRK», «BCAR1», «NFKB1»),
                       организм = "gp__TEXF_hZLM_d18")
#> Обнаружен пользовательский запрос источника по Гринвичу
head (custom_gostres $ result, 3)
#> запросить значимое значение p_value term_size query_size correction_size
#> 1 query_1 ИСТИНА 5.324995e-26 19 13 13
#> 2 query_1 TRUE 1.6
e-12 27 13 9
#> 3 query_1 TRUE 8.094988e-12 19 13 8
#> прецизионный вызов источника term_id
#> 1 1.0000000 0.6842105 BIOCARTA_CXCR4_PATHWAY biocarta
#> 2 0,6923077 0,3333333 BIOCARTA_PYK2_PATHWAY biocarta
#> 3 0,6153846 0,4210526 BIOCARTA_CCR3_PATHWAY biocarta
#> term_name
#> 1 http: // www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/cards/BIOCARTA_CXCR4_PATHWAY
#> 2 http://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/cards/BIOCARTA_PYK2_PATHWAY
#> 3 http://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb/cards/BIOCARTA_CCR3_PATHWAY
#> effective_domain_size source_order родители
#> 1 1476 47 NULL
#> 2 1476109 NULL
#> 3 1476 31 NULL  

Нет необходимости повторно загружать одни и те же файлы GMT каждый раз перед анализом обогащения.Его можно загрузить только один раз, а затем идентификатор можно будет использовать в любых дальнейших анализах обогащения, основанных на этом настраиваемом источнике. Тот же идентификатор также можно использовать в веб-инструменте в качестве токена в параметрах Custom GMT. Например, тот же запрос в веб-инструменте доступен по адресу https://biit.cs.ut.ee/gplink/l/jh4HdbUWQZ.

Выставка «Графические маневры» в галерее ГОСТ

На выставке представлены графические работы Александра Ливанова, Ольги Лозовской, Владимира Сальникова и Нины Бойлер.

В этот четверг, окт.7, в галерее ГОСТ (Москва, Малая Дмитровка, 29/4, выставочный зал «Чеховский дом») откроется выставка «Графические маневры» в рамках музейных расписаний ».

Галерея «ГО СТ» представляет собой неожиданные «графические маневры» первоклассных отечественных живописцев: Ливановой (1938 г.р.), Ольги Лозовой (1950 г.р.), Владимира Сальникова (1948 г.р.) и Нины Котель (1949 г.р.). рисуя утраченные позиции и вновь заявляя о независимости и самодостаточности графического искусства, оставаясь активными игроками в широком, противоречивом и бескомпромиссном художественном пространстве.

«Рисование - наука риска», - заметил Александр Ливан, и теперь его слова звучат более правдиво, чем когда-либо. искусство, призванное привлечь массовую аудиторию, рисование как художественный процесс остается где-то на периферии интересов широкого круга зрителей и искусствоведов. Современная художественная практика, накопившая богатый опыт в области перформанса, инсталляционного искусства и предметов, лишен розыгрыша статуса «освобождения времени» и отдает предпочтение художественным действиям и сиюминутным событиям, часто теряя путь творческого восприятия свежести и непосредственности переживаний.

Говоря единым голосом и преследуя общую цель, каждый из этих художников выбирает свою стратегию и свою тактику графических упражнений. Конечно, у них есть общая точка отсчета - натурный рисунок. Но речь идет не о подражании природе, не об изображении видимом, а о воображении, закодированном, преломленном и интерпретируемом в сознании художника.

Владимир Сальников маневрирует в диапазоне, казалось бы, пленэров, но романтически задуманных этюдов 1989 (1991) «Воспоминания Восточной Пруссии» (посвященных Каспару Давиду Фридриху) к суровым этюдам природы из цикла «В саду» (1988) ).

Жанровые метаморфозы в карандашных сериалах «Плюс и минус (1990)» Что ты сейчас думаешь по этому поводу, Роза? »(1990),« Деревянная новогодняя елка »(2002) Нина Котел происходят в амплитуде« пейзажа, натюрморта, портрета и возникают благодаря сознательному обрамлению образов, создавая увлекательную «киноколлекцию» анимированных вещей.

Полижанровые лирические композиции из цикла Ольги Лозовой («Крыши», 1980) стремятся к предельной графической абстракции, «напрягая белое по белому и раскрывая пространственный лист строгости».

Аналитические упражнения на натюрмортах Александра Ливанова 1970-90-х годов - это редкий пример точно и лаконично выстроенных структур, где военные четко выверены по дислокации графики каждого конкурента «упражнениями» в зоне оперативной ответственности. Его «пластические» маневры не подвержены манипуляциям и слишком чужды жанру повествования.

в целом небольшая, но сильная армия «маневрирующих» для показа художников определила следующие политики и стратегические ориентиры.Несмотря на то, что сегодня привычный график-карандаш заставляет занимать оборонительные позиции, и узор уже не может выступать универсальным способом картографирования мира, его основная функция - переводчик и посредник - остается актуальной вне зависимости от сиюминутного вкуса или социальных потребностей.